聯(lián)邦制藥化學(xué)藥物研究所成立于1998年，目前是廣東省企業(yè)技術(shù)中心、廣東省抗感染工程研究開發(fā)中心、博士后科研工作站、工程技術(shù)研究開發(fā)中心。主要負(fù)責(zé)聯(lián)邦制藥的化學(xué)藥物工藝研究、化學(xué)藥物質(zhì)量研究、穩(wěn)定性研究及項(xiàng)目申報(bào)（藥品注冊(cè)）。研發(fā)產(chǎn)品涉及抗生素、抗病毒、糖尿病系列、精神類、眼科用藥等領(lǐng)域。在研品種有10多種化學(xué)藥品處于不同的研發(fā)階段。
　　聯(lián)邦制藥化學(xué)藥物研究所現(xiàn)擁有一支專業(yè)齊全、結(jié)構(gòu)合理、具有國際視野的藥物研發(fā)和管理團(tuán)隊(duì)，研究員均具有本科及以上學(xué)歷，其中碩士研究生及以上學(xué)歷人員約占總?cè)藬?shù)的30%，具有專業(yè)技術(shù)職稱人員約占總?cè)藬?shù)的50%。同時(shí)，研究所具備完善的軟硬件實(shí)驗(yàn)條件，擁有包括意大利馬西姆氣流粉碎機(jī)、德國亞歷山大干法制粒機(jī)、英國malvern粒度分析儀、日本島津高效液相色譜儀等精密藥物研究設(shè)備，配備審計(jì)追蹤系統(tǒng)能有效保證研究所電子數(shù)據(jù)的完整性、安全性、準(zhǔn)確性及可追溯性。研究所還依托聯(lián)邦制藥的各生產(chǎn)基地，與生產(chǎn)車間無縫對(duì)接，構(gòu)建起新藥從實(shí)驗(yàn)到產(chǎn)業(yè)化的系統(tǒng)藥學(xué)研發(fā)管理體系，從而保證了藥物研發(fā)有序和高效地運(yùn)行。
　　化學(xué)藥物研究所自建立以來積極與國內(nèi)外高校、科研院所建立了長期友好的合作關(guān)系，形成“產(chǎn)學(xué)研”戰(zhàn)略合作聯(lián)盟，共同進(jìn)行有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)化學(xué)藥品的研發(fā)：與四川抗菌素工業(yè)研究所合作進(jìn)行抗病毒新藥開發(fā)及其他抗感染藥物研究；與中國科學(xué)院合作進(jìn)行老年癡呆藥物開發(fā)；與中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院合作進(jìn)行新型喹諾酮類抗生素及抗抑郁藥品開發(fā)；與中山大學(xué)合作進(jìn)行新型頭孢類抗生素的研究；與中國醫(yī)藥研究開發(fā)中心合作進(jìn)行糖尿病藥物開發(fā)；與重慶醫(yī)科大學(xué)合作進(jìn)行抗腫瘤藥物的研究等。
　　化學(xué)藥物研究所自建立以來開發(fā)各類新藥共100多個(gè)，為公司創(chuàng)造良好的經(jīng)濟(jì)效益打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)：2004年，公司推出的新藥憂必青（咪喹莫特乳膏）；2007年，公司推出新產(chǎn)品阿迪仙（阿德福韋酯膠囊）；2008年，倍能安（注射用亞胺培南西司他丁鈉）獲批上市；2011年，公司推出倍能美（注射用美羅培南），同年，他唑仙（注射用哌拉西林鈉他唑巴坦鈉（4:1））獲批上市；2013年，鹽酸美金剛片、鹽酸美金剛口服溶液作為首仿藥品獲批上市。
　　聯(lián)邦制藥化學(xué)藥物研究所未來將主要從事抗感染、糖尿病、神經(jīng)系統(tǒng)疾病、心腦血管疾病、內(nèi)分泌、眼科用藥等多個(gè)治療領(lǐng)域新產(chǎn)品的研究開發(fā)，不斷拓寬藥物研究領(lǐng)域，廣泛開展交流合作，按照集團(tuán)發(fā)展要求和市場(chǎng)開發(fā)需要，培育具有較強(qiáng)市場(chǎng)竟?fàn)幜Φ暮诵募夹g(shù)產(chǎn)品；并嚴(yán)格貫徹公司“創(chuàng)新是企業(yè)發(fā)展的根本動(dòng)力”的研發(fā)戰(zhàn)略，積極進(jìn)取，為人類醫(yī)藥事業(yè)的發(fā)展而不懈努力，讓生命更有價(jià)值。